Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RIMKLBQ9ULI2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms