Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLKQ9UBT6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLKQ9UBT6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms