Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
VPS29Q9UBQ0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VPS29Q9UBQ0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms