Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RRBP1Q9P2E9 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RRBP1Q9P2E9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms