Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP36Q9P275 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP36Q9P275 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms