Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2V7

SPNS1, Protein spinster homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1Q9H2V7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPNS1Q9H2V7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms