Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NIFKQ9BYG3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms