Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
SNHG12Q9BXW3 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SNHG12Q9BXW3 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms