Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EDAQ92838 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EDAQ92838 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDAQ92838 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDAQ92838 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDAQ92838 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDAQ92838 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDAQ92838 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDAQ92838 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDAQ92838 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDAQ92838 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDAQ92838 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDAQ92838 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EDAQ92838 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EDAQ92838 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms