Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GIPC3Q8TF64 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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