Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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ZNF548Q8NEK5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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ZNF548Q8NEK5 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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ZNF548Q8NEK5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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