Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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GEN1Q17RS7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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GEN1Q17RS7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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GEN1Q17RS7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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GEN1Q17RS7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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GEN1Q17RS7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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