Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ATP6V1FQ16864 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ATP6V1FQ16864 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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