Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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HIF1AQ16665 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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HIF1AQ16665 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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