Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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DDB1Q16531 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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DDB1Q16531 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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DDB1Q16531 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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DDB1Q16531 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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DDB1Q16531 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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DDB1Q16531 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
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DDB1Q16531 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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DDB1Q16531 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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