Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPE65Q16518 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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