Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZFHX3Q15911 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms