Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ALX1Q15699 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALX1Q15699 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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