Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
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UBE3CQ15386 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
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UBE3CQ15386 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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UBE3CQ15386 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
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UBE3CQ15386 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
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UBE3CQ15386 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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UBE3CQ15386 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
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UBE3CQ15386 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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UBE3CQ15386 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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UBE3CQ15386 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE3CQ15386 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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