Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRKQ15262 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRKQ15262 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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