Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COL19A1Q14993 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms