Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
FHL3Q13643 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms