Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
SEMA5AQ13591 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEMA5AQ13591 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms