Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C1orf61Q13536 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms