Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PTP4A2Q12974 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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