Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXD4Q12950 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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