Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CYP4F3Q08477 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms