Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TGM3Q08188 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms