Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GBE1Q04446 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GBE1Q04446 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms