Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CENPEQ02224 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms