Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
OTUD4Q01804 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms