Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CACNA1BQ00975 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms