Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKOR1P84550 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms