Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
USP46P62068 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
USP46P62068 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP46P62068 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP46P62068 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP46P62068 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP46P62068 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP46P62068 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP46P62068 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP46P62068 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP46P62068 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP46P62068 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP46P62068 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP46P62068 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP46P62068 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP46P62068 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP46P62068 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP46P62068 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP46P62068 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP46P62068 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
USP46P62068 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP46P62068 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP46P62068 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
USP46P62068 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP46P62068 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP46P62068 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP46P62068 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP46P62068 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP46P62068 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP46P62068 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP46P62068 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
USP46P62068 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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