Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ACTBP60709 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTBP60709 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTBP60709 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTBP60709 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTBP60709 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTBP60709 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTBP60709 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTBP60709 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTBP60709 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTBP60709 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACTBP60709 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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ACTBP60709 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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ACTBP60709 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACTBP60709 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACTBP60709 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ACTBP60709 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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ACTBP60709 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACTBP60709 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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ACTBP60709 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACTBP60709 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACTBP60709 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACTBP60709 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACTBP60709 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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ACTBP60709 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACTBP60709 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACTBP60709 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACTBP60709 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACTBP60709 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACTBP60709 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACTBP60709 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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