Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBASH3AP57075 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms