Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLCSP50747 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLCSP50747 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLCSP50747 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLCSP50747 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLCSP50747 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLCSP50747 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLCSP50747 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLCSP50747 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLCSP50747 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLCSP50747 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLCSP50747 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLCSP50747 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLCSP50747 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLCSP50747 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLCSP50747 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLCSP50747 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLCSP50747 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLCSP50747 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLCSP50747 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLCSP50747 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLCSP50747 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms