Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCT3P49368 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCT3P49368 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCT3P49368 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCT3P49368 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCT3P49368 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms