Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms