Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SPRR1AP35321 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms