Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFTPDP35247 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SFTPDP35247 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SFTPDP35247 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SFTPDP35247 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SFTPDP35247 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SFTPDP35247 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SFTPDP35247 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SFTPDP35247 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SFTPDP35247 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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SFTPDP35247 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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