Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA4P35212 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GJA4P35212 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GJA4P35212 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms