Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCKBRP32239 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms