Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PEX2P28328 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PEX2P28328 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms