Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
VAMP1P23763 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
VAMP1P23763 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms