Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP4AP20648 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms