Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPB42P16452 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EPB42P16452 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EPB42P16452 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms