Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ACTN1P12814 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ACTN1P12814 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms