Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RLBP1P12271 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLBP1P12271 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLBP1P12271 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLBP1P12271 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLBP1P12271 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLBP1P12271 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLBP1P12271 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLBP1P12271 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RLBP1P12271 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RLBP1P12271 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RLBP1P12271 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RLBP1P12271 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RLBP1P12271 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RLBP1P12271 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RLBP1P12271 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms