Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC192P0DO97 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC192P0DO97 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms